Knjižni fond pokriva različite oblasti: povijest, arheologiju, numizmatiku, muzejsku djelatnost, umjetnost, prirodne znanosti, književnost i drugo. Znatan dio čine knjige u kojima je obrađeno područje Bosne i Hercegovine, te grada Travnika. Poseban dio ove knjižnice su periodična izdanja, različiti, zbornici, glasnici, časopisi i slično. Najvrjednija sastavnica ove knjižnice su stara i rijetka izdanja koja imaju kako knjižničnu tako i muzejsku vrijednost.
Knjižni fond se obogaćuje na različite načine: razmjenom u najvećem broju, poklonima, i u manjoj mjeri kupovinom. Ove godine je po treći puta od ustrojavanja muzejske knjižnice provedena revizija – inventura knjižnog fonda.
Konstatirano je da muzejska knjižnica danas posjeduje 8.091 monografsku knjižnu jedinicu, a od 534 različita naslova u okviru periodike u knjige inventara uneseno je 2.812 periodičnih publikacija. /o.t./